Инбридинг, как много в этом слове!

[Toy Art]

И конечно с инбридингом многие генетические проблемы закрепились в поколениях...

Инбридингом не закрепляют генетических проблем.

Ожидаемые значения
Низкие значения COI считаются "безопасными" и менее склонными производить наследственные заболевания.

Инбридинг в принципе не может "производить наследственные заболевания" - он лишь выявляет имеющиеся, переводя "дефективные"гены в гомозиготное состояние.

Тем не менее, когда генетическая проблема широко распространена в породе, собака с низким COI может столь же вероятно иметь генетические расстройства, как и собака с высоким COI.

Абсолютно точно.
Не "закрепить" , а распространить в породе нежелательные признаки, в том числе и генетические заболевания, может широкое использование знаменитых и популярных производителей-носителей, - была здесь об этом интересная статья - "Проклятье популярного производителя" - так кажется назыалась..."

А поскольку большинство препотентных производителей-улучшателей получено именно путём инбридинга, у народа путается причина со следствием.
И виновным "назначается" сам инбридинг.