Генетика

[Magic Mist]

Сообщение от Toy Art

В ЧЕМ Вы видите противоречие?

Сообщение от Toy Art

Коричневый и пятнистый окрасы - ПРИСУТСТВОВАЛИ в популяции ИЗНАЧАЛЬНО.

Сообщение от Toy Art

Предметом спора о "модернОнвых" окрасах было СОВСЕМ иное различие - речь шла об искусственно "вытащенных" - по выражению Насти - окрасах. ОТСУТСТВОВАВШИХ в исходной популяции(серебристом и абрикосовом)

Противоречие утверждений этих в том, что - к примеру - и гены осветлители (как и коричневый рецессив) в породе присутствовали изначально.

И коричневый окрас вычленили и стали разводить точно так же по сути - как и серебро. Просто с серебром и рыжим наследование не такое простое, вот и вся разница.

[Toy Art]

Сообщение от Magic Mist

Противоречие утверждений этих в том, что - к примеру - и гены осветлители (как и коричневый рецессив) в породе присутствовали изначально.

И коричневый окрас вычленили и стали разводить точно так же по сути - как и серебро. Просто с серебром и рыжим наследование не такое простое, вот и вся разница.

Коричневый окрас (наряду с бело-пятнистым) присутствовал в популяции пуделе-спаниеле-образных Европы изначально...
И для проявления этого (да-разумеется!) рецессивного но при этом ПЕРЕДАЮЩЕГОСЯ ПО МОНОГЕННОЙ СХЕМЕ НАСЛЕДОВАНИЯ, а значит - способного "тянуться" в поголовье бесконечно долго, невзирая на любые выбраковки....
Поэтому:
Их "вытаскивать" - по твоему выражению - и НЕ НУЖНО БЫЛО - достаточно просто было прекратить выбраковку "постоянно появлявшихся"(цитата) в пометах щенков...

А вот "современные" окрасы - с ними совсем другая песня - они потому так и названы , что ОТСУТСТВОВАЛИ в исходной популяции.
И "вытащили" их - по твоей же собственной версии - мощнейшей концентрацией генов-осветлителе (как минимум)- признака, наследуемого по ПОЛИГЕННОЙ - т.е. "накопительной" системе , что и привело к многократному усилению возможностей (учитывая смешанное разведение) их нежелательного влияния на другие окрасы...
В РОДСТВЕННЫХ пуделю породах, где подобных экспериментов не проводилось и уровень концентрации генов-осветлителей (разумеется - они тоже ЕСТЬ!) остался на прежнем уровне, - такого разрушительного их действия не коричневый (а вместе с ним и черный!) окрас мы не наблюдаем....
Там коричневые(и черные) собаки практически рождаются и старятся "в одном цвете"..
В чем противоречие?

[Magic Mist]

Сообщение от emerei

Самое главное, не стоит оперировать одними только "ввее".

Согласная.

Но Тань... для многих собаководов, как я вижу очень часто и даже осознание смысла простых - и, можно сказать, базовых - двух аллелей "ввее" - уже фантастический научный прорыв.

[Magic Mist]

Сообщение от Toy Art

- в принципе практически соответствует "сплошному черному" с разницей в один ген;

Соболь и подпал тоже частенько соответствуют "сплошному черному" с разницей в один ген...

[Toy Art]

Сообщение от Magic Mist

Соболь и подпал тоже частенько соответствуют "сплошному черному" с разницей в один ген...

Если мы с тобой говорим об ОКРАСОООБРАЗУЮЩИХ аллелях, то....
Как минимум - ДВА.
Мы уже с тобой как-то это обсуждали - что тестирование на один аллель at НЕДОСТАТОЧНО для того чтобы "выцепить" подпалышей...))))))))

[Magic Mist]

Сообщение от Magic Mist

Соболь и подпал тоже частенько соответствуют "сплошному черному" с разницей в один ген...

BBEEKK - гомозиготный черный

bbEEKK - гомозиготный коричневый

BBEEkk - гомозиготнтый агути (соболь, чепрак, подпал)

если хоть один ген в К-аллеле доминантный, то собака будет сплошного "не- агути" окраса, два рецессивных - появляется агути.

Более надоедать не стану, похоже моё недостаточно компетентное и не квалифицированное ( и крайне однообразно занудное) присутствие в данной теме это стресс-фактор - для остроумных.

За сим откланяюсь, займусь простыми полезными делами - собачек своих помою-постригу.

[Toy Art]

Сообщение от Magic Mist

BBEEKK -
Более надоедать не стану, похоже моё недостаточно компетентное и не квалифицированное ( и крайне однообразно занудное) присутствие в данной теме это стресс-фактор - для остроумных. .

Ну я-то ведь сразу оговорилась - "если мы говорим - об окрасообразующих аллелях"....))))))
А для окрасов группы агути аллели a_ - в любом случае в окрасообразующую формулу ВХОДЯТ.
Ведь если собака окажется не "соболиной" и не "подпалой", а "рецессивной черной" - то все равно она будет "сплошного"(черного или коричневого) окраса....
Это для группы "сплошных" окрасов аллель агути в формуле можно и не указывать...)))))

Настя, твое - серьезно! - одно из самых "подкованных"! - мнение - ВСЕГДА интересно!
Неужели не замечаешь - как часто в вопросах, вызвавших затруднения у собравшихся (без тебя) участников - тут же адресуются за разъяснениями именно к тебе?..

А по поводу "стресса" у "остроумных" или считающих себя таковыми - тебе ли переживать?)))))))

[Magic Mist]

МНС, в данном случае - а именно - Ваш пост просто вызвал некоторые смысловые "разночтения" . Я, честно признаться, скорее ожидала уточняющего следующего поста, но никак не удаления изначального. Нахожусь в некотором недоумении.

Сомневаюсь, что модерирование постов "сверху" уместно в этой конкретной ситуации. Да и стартовый пост удалять не было резону. ИМХО.

Лично мне очень жаль, что из-за отношения к окружающим некоторых форумчан мы так редко можем видеть Вас в данной теме, а мнение квалифицированного специалиста было бы знать крайне полезно и очень интересно.

Но почему Вы тут не хотите писать я тоже понимаю, увы.

[Toy Art]

Сообщение от Magic Mist

МНС,
Лично мне очень жаль, что из-за отношения к окружающим некоторых форумчан мы так редко можем видеть Вас в данной теме, а мнение квалифицированного специалиста было бы знать крайне полезно и очень интересно.

Но почему Вы тут не хотите писать я тоже понимаю, увы.

ППКС!

Действительно - очень жаль, что так много действительно интересных, думающих людей, способных поделиться своими знаниями,
либо просто ушли с форума,
либо практически перестали участвовать в обсуждениях,
которые из собственно обсуждений сути проблем превращаются в бесконечные "физ.куль.паузы", используемые некоторыми пользователями для упражнений в том, что они считают остроумием...(((((

[Zlato-Sibiri]

Magic Mist, всегда интересно тебя читать!!!

[Outia]

Может быть, кому то будет интересно, хотя российские учёные не были приглашены.....

Шведской Кинологической Организации удалось собрать 140 участников из 20 стран для Первого Международного Семинара по улучшению генетического здоровья чистопородных собак, который проходил в первую неделю июня 2012.

Весь текст в газете ФЦИ.

http://newsletter9.dogdotcom.be/fr/WorkshopSweden.aspx

Вторая международная встреча по генетическому здоровью собак пройдёт в Дюссельдорфе, 31 мая и 1 июня 2014 года. Встречу учёных будет организовывать профессор Peter Freidrich - Президент VDH.

Все подробности этой важной первой международной встречи по генетическому здоровью собак на сайте организатора -Шведского Кеннела. Нажимайте на зелёные ссылки внизу, будут открываться портреты основных участников встречи. Из разных стран мира. Европы и Америки.

http://www.skk.se/in-english/dog-health-workshop-2012/

[Outia]

Наверное, большинству форумчан удобнее в английской версии почитать газету ФЦИ, а потом перейти по ссылке на Шведский Кеннел.

http://newsletter9.dogdotcom.be/en/WorkshopSweden.aspx

[Outia]

На сайте Шведского Кеннела, когда будете нажимать на зелёные ссылки основных аспектов семинара, то откроются портреты, нужно нажимать под последним портретом на "read more" и откроется освещаемый сюжет.

Много там материала. Молодцы шведы, такую грандиозную международную встречу по генетическому здоровью собак организовать!

[Tamara]

Dogs Adapted to Agriculture
As wolves became domesticated, their genes adapted to a starch-rich diet of human leftovers.
By Ed Yong | January 23, 2013

Tamaskan dog
WIKIMEDIA, ALLISON LAING

Comparison of the full genomes of dogs and wolves revealed many changes that accrued as wild canines evolved into man’s best friend. Unsurprisingly, many of these differing regions regions affect the brain, and may explain the different temperaments of wolves and dogs. But the comparison, published today in Nature also pinpointed several regions that are involved in digestion, including genes that help to break down starch.

“This supports the idea that proto-dogs evolved new digestive adaptations to rely on the edible by-product of the agricultural revolution – garbage,” said Brian Hare from Duke University, who studies animal domestication and was not involved in the study.

Israeli fossils and genetic studies date dog domestication to around 10,000 years ago, coinciding with the Agricultural Revolution, when humans went from nomadic hunter-gatherers to farming and living in settlements. Some scientists have suggested that wolves were attracted to dump sites near these early settlements and scavenged on leftovers from vegetables and cereal plants. “Dogs may have domesticated themselves by seeking out humans, to eat from their scrap-heaps,” said Kerstin Lindblad-Toh from Uppsala University, who led the new research.

Lindblad-Toh led the team that published the full domestic dog genome back in 2005. With that project completed, she turned to the evolutionary history of our canine companions. “While a lot of studies have looked at the when and where of dog domestication, little has been done to understand how this happened on a genomic level,” she said.

Together with Erik Axelsson, Lindblad-Toh sequenced the full genomes of 12 wolves from around the world, as well as 60 dogs representing 14 diverse breeds. They searched for signatures of domestication by looking for sequences that that showed the greatest differences between dogs and wolves, or for sequences that were consistent across dog breeds but varied in wolves.

The team eventually came up with a list of 36 regions, containing a total of 122 genes. Half of these regions contained brain genes. “This is not surprising,” said Lindblad-Toh. Compared to wolves, dogs are less aggressive, more sociable, less afraid of humans, and better able to read our behavioral cues.

Six other regions, containing 10 genes, were involved in digesting fat and starch. Specifically, dogs carry extra copies of the gene for amylase—an intestinal enzyme that cuts starch into maltose—and now produce 28 times more of the protein than their wolf counterparts. Dogs also produce 12 times more maltase-glucoamylase, which converts maltose into sugar, thanks to several mutations in the gene for this enzyme. Mutations in a third gene—SGLT1—improved the function of a protein that absorbs the sugar through the gut.

“They have made a very convincing case for the involvement of starch digestion in the evolution of the dog,” said Ben Sacks from the University of California, Davis, who was not involved in the study. (Interestingly, some of the changes observed in dog digestion have parallels in humans. As we moved from hunting meat and gathering berries to farming grains and vegetables, we, too, duplicated our amylase gene, which some have seen as an adaptation to a starch-rich diet.)

Rodney Honeycutt, an evolutionary geneticist from Pepperdine University, was also impressed by the data, but noted that it is unclear when these changes took place. “The ability to digest starch effectively would not necessarily make an animal docile, and may have occurred subsequent to domestication,” he said.

But Lindblad-Toh argued that mental and digestive changes are likely to go hand in hand. “Dogs that were not afraid of people and that could adapt to a more omnivorous diet may have been the ones that stayed and were domesticated,” she said.

E. Axelsson et al., “The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet,” Nature, 2013: doi:10.1038/nature11837, 2013.

http://www.the-scientist.com//?articles.view/articleNo/34095/title/Dogs-Adapted-to-Agriculture/

[Tamara]

Собаки адаптировались к сельскому хозяйству (имеется в виду в процессе эволюции - ТП)

В процессе доместикации волков они генетически адаптировались к поеданию остатков человеческой еды богатых крахмалом.

By Ed Yong | January 23, 2013

Tamaskan dog
WIKIMEDIA, ALLISON LAING

Сравнение геномов собак и волков обнаружило много изменений накопленных в процессе эволюции лучшего друга человeка. Как и ожидалось, многие из этих изменённых участков ДНК затрагивают нервную систему, что возможно обьясняет разницу в темпераменте волков и собак. Но также это сравнение, опубликованное в сегодняшнем выпуске журнала Nature, выявило несколько участков ответственных за пищеварение.

По словам Brian Hare from Duke University, который изyчает доместикацию животных и не принимал участия в данном исследовании, "это подтверждает что примитивные собаки в процессе эволюции обзавелись пищеварительными адаптациями питаясь побочными продуктами сельскохозяйственной революции, или по-просту помоями"

Израильские археологические и генетические исследования датируют одомашнивание собак 10 000 лет назад, что по-времени совпадает с сельскохозяйственной революцией, когда люди перешли от охоты и собирательства к земледелию и осёдлому образу жизни. "Собаки, возможно, одомашнились примкнув к людским поселениям привлечённые остатками еды" говорит автор исследования Kerstin Lindblad-Toh from Uppsala University.

Lindblad-Toh руководит группой учёных опубликовавших геном собаки в 2005 году. В настоящее время она изучает эволюцию собак. "В то время как многие исследования изучают когда и где собаки были одомашнены, немногое известно о том КАК происходила доместикация на генетическом уровне".

Lindblad-Toh, совместно с Erik Axelsson, секвенировали геномы 12 волков со всего мира, а также 60 собак 14 пород. Они искали признаки доместикации сравнивая участки ДНК наиболее различающиеся у волков и собак. Учёные обнаружили 36 таких участков содержащих 122 гена. Половина из этих генов относится к нервной системе. "Это не удивительно" говорит Lindblad-Toh. По сравнению с волками, собаки менее агрессивны, лучше поддаются социализации, меньше боятся человека, и более восприимчивы к нашим поведенческим сигналам.

Шесть других выявленных участков ДНК, содержащих 10 генов, играют роль в пищеварении жиров и крахмала. Конкретно - геном собаки содержит дополнительные копии гена кодирующего амилазу - кишеный фермент превращающий крахмал в мальтозу, и соответственно собаки производят в 28 раз больше амилазы чем волки. Также, благодаря нескольким мутациям, собаки производят в 12 раз больше мальтазы - гликоамилазы, которая превращает мальтозу в глюкозу. Мутации в ещё одном гене - SGLT1 - усиливают функцию белка способствующего всасыванию глюкозы в кишечнике.

"Предоставленные доказательства связи пищеварения углеводов и эволюции собак вполне убедительны", говорит Ben Sacks from the University of California, Davis, не учавствовавший в исследовании. (Интересно, что некоторые эволюционные изменения наблюдаемые у собак имеют место и в эволюции людей. В процессе перехода от охоты и собирательства к выращиванию зерновых и овощей ген амилазы у нас тоже дуплицировался, что можно считать адаптацией к пище богатой крахмалом. )

Rodney Honeycutt, генетик из Pepperdine University, также впечатлён данными этого исследования, с оговоркой что не совсем ясно когда эти генетические изменения произошли. " Способность животного переваривать крахмал необязательно сделает его послушным, так что этот признак мог появиться и после доместикации" отмечает он.

Но Lindblad-Toh считает что поведенческие и пищеварительные изменения происходили одновременно. "Собаки которые не боялись людей и являлись более всеядными вероятно и были одомашнены" считает она.

E. Axelsson et al., “The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet,” Nature, 2013: doi:10.1038/nature11837, 2013.